История санатория «Янган-Тау» берет свое начало со 2 апреля 1937 года, когда президиум ЦИК БАССР принял постановление «О строительстве курорта Янган-Тау Малоязовского района Башкирии». На его основании летом того же года была образована опытная клиническая станция со стационаром на 20 коек, а в 1944 году уже создан сам санаторий.