Между тем, отмечалось на совещании, основным недостатком в работе городского пассажирского транспорта в Уфе пока остается «отсутствие гибкости в управлении перевозочными процессами и координации работы автопредприятий ГУП «Башавтотранс» с горэлектротранспортом и частными автоперевозчиками».Проблемными являются и «вопросы работы нелегальных автобусов, которые осуществляют пассажирские перевозки без заключения договоров с администрацией города». Как говорилось на совещании, многие автобусы не соответствуют требованиям по внешнему и внутреннему состоянию, осуществляют выезд только в часы «пик» и устраивают гонки в погоне за пассажиром, тем самым создают аварийные ситуации на улицах города.Также обозначено, что «не в полной мере определены проектные решения по специализированным внутригородским автостанциям (разворотные кольца и места межрейсового отстоя задействованного в перевозках пассажиров транспорта)». В настоящее время они практически отсутствуют и необходимо создание новых разворотных колец и размещение конечных автобусных остановок.