Цветок курая на флаге — знак дружбы, семь его лепестков, символизируют семь родов, положивших начало единению народов, проживающих на территории Республики Башкортостан. Зеленый цвет на флаге означает свободу, вечность жизни; белый — миролюбие, открытость, готовность к взаимному сотрудничеству народов Республики Башкортостан; синий — ясность, добродетель и чистоту их помыслов.